Com o estatuto de associação privada, sem fins lucrativos e apolítica, ao abrigo das Leis de Portugal, a estrutura de administração consiste em: um Capítulo, a Assembleia Geral que nomeia a Chanceleria; uma Direção de cinco pessoas, que governa a Confraria; e a Mesa de Vendores, que supervisiona as despesas orçamentais.

Para cumprir a sua missão como um influenciador único com uma visão inovadora, enquanto defende as melhores tradições do Vinho do Porto, a Confraria acolhe na sua organização membros com mais de 18 anos de idade que se unem numa comunidade de Confrades no sentido de contribuir para reforçar e aumentar a reputação do Vinho do Porto em todo o mundo. Distinguem-se em dois grupos:

Efectivos

Membros de produtores e exportadores de Vinho do Porto registados que são responsáveis pela produção, promoção e exportação de Vinho do Porto, sejam eles comerciantes individuais, diretores ou gestores de empresas.

Honorários

Pessoas ou organizações que, pelas suas ações, reputação, ou posição, contribuem significativamente para a imagem e o conhecimento do Vinho do Porto.